目前微反应器在化工工艺过程的研究与开发中已经得到广泛的应用，商业化生产中的应用正日益增多。其主要应用领域包括有机合成过程，微米和纳米材料的制备和日用化学品的生产。在化工生产中，新的Miprowa技术已经可以实现每小时上万升的流量。
微反应器的微结构大的缺点是固体物料无法通过微通道，如果反应中有大量固体产生，微通道极易堵塞，导致生产无法连续进行。
目前这一问题主要是通过改进反应器的设计来解决。例如拜耳-埃尔费尔德微技术公司开发的阀式混合器（反应器）可以用于快速沉淀反应，基于这一技术，拜耳公司成功开发了商业化生产工艺，用于生产高的性能的微米材料和纳米材料。
微通道反应器采用凸轮曲线补偿和流量脉冲电子抑制技术，有效控制流体压力脉冲；浮动柱塞设计，减少高压密封圈的磨损，提高 密封圈的使用寿命，凸轮传动设计，瑞士原装的进口单向阀，，故障率低。微通道反应器操作界面人性化，内置10个用户程序，可实现流量、梯度编程，人性化的人机界面；计算机反控通讯协议是开源的，也可以使用其它常用的工作站控制泵的操作。
微通道反应器不同于其他反应器的一些明显优势
反应器，用于实现液相单相反应过程和液液、气液、液固、气液固等多相反应过程。器内常设有搅拌(机械搅拌、气流搅拌等)装置。在高径比较大时，可用多层搅拌桨叶。在反应过程中物料需加热或冷却时，可在反应器壁处设置夹套，或在器内设置换热面，也可通过外循环进行换热。
而微通道反应器（微反应器），利用精i密加工技术制造的特征尺寸在10到300微米（或者1000微米）之间的微型反应器，微反应器的“微”表示工艺流体的通道在微米级别，而不是指微反应设备的外形尺寸小或产品的产量小。微反应器是一个比较广泛的概念，并有很多形式，既包括传统的微量反应器，也包括聚合反应器、反相胶束条纹反应器、微聚合反应器和固体模板微反应器等。这些微反应器的对化学反应的共同特点是将其控制在很微小的空间内，反应通道的平均尺寸一般为微米甚至纳米。微反应器中可以包含有成百万上千万的微型通道，因此也实现很高的产量。
连续流化学提高了化学反应的效率
连续流化学的生产手段正在制药研发中受到重视，考虑到其以下优势：更好的工艺过程，安全性更优的质量空间，节省更高的产能，以其简单的形式，连续流动化学始于两种以上的物料，比如起始反应物，这些物料流以设定流速用泵打入反应舱室、反应管，流进反应舱室的不同反应物料在此进行混合和反应。
根据反应动力学和物料流速，需要保证反应物料在微型反应器中达到某一特定的停留时间，从而获得预期的反应转换率，相继，从微型反应器出口流出的物料用烧瓶或其它适当的容器收集起来。
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